Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LETM2Q2VYF4 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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