Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MICAQ29983 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MICAQ29983 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MICAQ29983 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MICAQ29983 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MICAQ29983 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MICAQ29983 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MICAQ29983 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MICAQ29983 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MICAQ29983 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MICAQ29983 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MICAQ29983 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MICAQ29983 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MICAQ29983 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MICAQ29983 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MICAQ29983 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MICAQ29983 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MICAQ29983 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MICAQ29983 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MICAQ29983 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MICAQ29983 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MICAQ29983 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MICAQ29983 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MICAQ29983 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MICAQ29983 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MICAQ29983 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
MICAQ29983 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
MICAQ29983 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
MICAQ29983 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
MICAQ29983 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
MICAQ29983 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
MICAQ29983 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MICAQ29983 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MICAQ29983 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MICAQ29983 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MICAQ29983 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MICAQ29983 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MICAQ29983 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
MICAQ29983 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MICAQ29983 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MICAQ29983 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MICAQ29983 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MICAQ29983 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms