Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 FAS-204ENST00000355740 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 GOLGA8O-201ENST00000509311 1997 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 PLD5-204ENST00000442594 3305 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
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CTF1Q16619 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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CTF1Q16619 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 CRHR2-201ENST00000341843 3131 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 CYP11B1-204ENST00000517471 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 PLA2G4E-AS1-201ENST00000499478 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
CTF1Q16619 PTGR2-204ENST00000555228 2543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 AC005696.4-201ENST00000614400 3147 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 FAM230B-208ENST00000451257 3566 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CTF1Q16619 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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