Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 DCDC2B-201ENST00000409358 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 PIGL-202ENST00000395844 1257 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 COX14-204ENST00000550654 580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 LINC02130-201ENST00000566054 518 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 AC005332.2-201ENST00000590010 930 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 PLA2G4C-AS1-203ENST00000601950 454 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 AL109954.3-201ENST00000615088 558 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 FAM157C-201ENST00000563357 1806 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 AL031577.1-201ENST00000339867 399 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 AC096536.3-201ENST00000415336 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 TMCO1-203ENST00000464650 1100 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 TRBV11-2-201ENST00000471935 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 THEG-204ENST00000530711 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 AC025259.1-201ENST00000550301 647 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 AC012594.1-273ENST00000626618 816 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 IQCF1-201ENST00000310914 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 ASLP1-201ENST00000428790 637 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 RN7SL363P-201ENST00000482412 273 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 MYCBP-203ENST00000494695 750 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 AC090200.1-201ENST00000522918 590 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 TRPC5OS-203ENST00000635763 955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 AL590094.1-206ENST00000635959 478 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 AL590094.1-209ENST00000637260 499 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 SP140L-205ENST00000458341 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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