Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
PTCH1Q13635 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms