Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DSC2Q02487 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms