Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms