Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX1P83916 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX1P83916 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX1P83916 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX1P83916 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX1P83916 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX1P83916 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX1P83916 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX1P83916 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX1P83916 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX1P83916 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX1P83916 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX1P83916 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX1P83916 FCHO1-208ENST00000595033 2907 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX1P83916 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX1P83916 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX1P83916 SYPL2-201ENST00000369872 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX1P83916 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX1P83916 UGT1A5-201ENST00000373414 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX1P83916 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX1P83916 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX1P83916 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX1P83916 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX1P83916 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX1P83916 LINC-PINT-208ENST00000451786 3505 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX1P83916 FCRLA-206ENST00000367949 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX1P83916 NOSTRIN-203ENST00000397209 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX1P83916 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX1P83916 CFAP43-204ENST00000369720 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX1P83916 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX1P83916 TP73-206ENST00000378288 5120 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 TRPV1-204ENST00000425167 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 NPNT-202ENST00000379987 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 ARMCX2-203ENST00000356824 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 CPT1B-203ENST00000395650 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 AGAP6-203ENST00000618025 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 REXO5-201ENST00000261377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 NLGN3-202ENST00000374051 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 LINC01544-201ENST00000567801 5168 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 PTPN1-201ENST00000371621 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 SERPINH1-202ENST00000524558 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 TAOK2-201ENST00000279394 4246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 CEACAM20-201ENST00000611497 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 ARHGEF9-220ENST00000635729 1761 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 CCAR2-206ENST00000520861 3560 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 SCML1-204ENST00000398080 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 HK2P1-201ENST00000447818 2737 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 CNTROB-202ENST00000563694 3705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 VWCE-208ENST00000613271 3032 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CBX1P83916 WDR62-203ENST00000401500 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 ILF3-202ENST00000407004 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 SQSTM1-201ENST00000360718 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 DENND2A-210ENST00000537639 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 EZR-203ENST00000392177 2933 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 MYADM-204ENST00000391770 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 PLEKHM1P1-202ENST00000578036 4318 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 AOC1-207ENST00000493429 3135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CBX1P83916 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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