Protein–RNA interactions for Protein: P81408

FAM189B, Protein FAM189B, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM189BP81408 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAM189BP81408 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAM189BP81408 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms