Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MCCD1P59942 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MCCD1P59942 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MCCD1P59942 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MCCD1P59942 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MCCD1P59942 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MCCD1P59942 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MCCD1P59942 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MCCD1P59942 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MCCD1P59942 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCCD1P59942 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCCD1P59942 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCCD1P59942 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCCD1P59942 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MCCD1P59942 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MCCD1P59942 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MCCD1P59942 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MCCD1P59942 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MCCD1P59942 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCCD1P59942 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
MCCD1P59942 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MCCD1P59942 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCCD1P59942 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MCCD1P59942 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MCCD1P59942 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCCD1P59942 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCCD1P59942 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MCCD1P59942 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCCD1P59942 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MCCD1P59942 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCCD1P59942 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCCD1P59942 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCCD1P59942 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCCD1P59942 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCCD1P59942 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCCD1P59942 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCCD1P59942 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MCCD1P59942 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MCCD1P59942 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCCD1P59942 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
MCCD1P59942 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCCD1P59942 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MCCD1P59942 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCCD1P59942 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCCD1P59942 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MCCD1P59942 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms