Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 LINC01209-201ENST00000451289 2400 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 KCNH1-202ENST00000367007 3445 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 QRICH1-204ENST00000424300 3009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 AC126564.1-201ENST00000623628 2013 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 KLC4-201ENST00000259708 2688 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 CIZ1-205ENST00000372948 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 SEPT10-202ENST00000397712 3071 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 ZBTB26-201ENST00000373654 2047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 LDLR-203ENST00000535915 2768 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 TRO-202ENST00000319167 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 TRO-203ENST00000375022 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 GRK7-201ENST00000264952 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 PLD5-204ENST00000442594 3305 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 RALGDS-203ENST00000372062 3596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 MARCH10-209ENST00000583600 3214 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 HYOU1-221ENST00000621959 3358 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 KCNH1-205ENST00000638498 3479 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 RBM39-243ENST00000528062 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2BFSP57053 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.9 ms