Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 SMIM10L1-201ENST00000622602 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 LINC01428-201ENST00000449581 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 LITAF-203ENST00000413364 2292 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 CEP68-201ENST00000260569 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SH3BGRP55822 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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