Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP3M2P53677 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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