Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP4P49662 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP4P49662 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP4P49662 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms