Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BRCC3P46736 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BRCC3P46736 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BRCC3P46736 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BRCC3P46736 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRCC3P46736 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRCC3P46736 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRCC3P46736 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BRCC3P46736 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRCC3P46736 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRCC3P46736 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRCC3P46736 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRCC3P46736 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BRCC3P46736 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BRCC3P46736 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BRCC3P46736 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BRCC3P46736 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BRCC3P46736 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BRCC3P46736 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BRCC3P46736 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BRCC3P46736 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
BRCC3P46736 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BRCC3P46736 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BRCC3P46736 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BRCC3P46736 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BRCC3P46736 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRCC3P46736 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BRCC3P46736 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BRCC3P46736 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRCC3P46736 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BRCC3P46736 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BRCC3P46736 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRCC3P46736 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BRCC3P46736 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BRCC3P46736 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRCC3P46736 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BRCC3P46736 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRCC3P46736 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BRCC3P46736 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRCC3P46736 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BRCC3P46736 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BRCC3P46736 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BRCC3P46736 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BRCC3P46736 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BRCC3P46736 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRCC3P46736 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRCC3P46736 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRCC3P46736 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BRCC3P46736 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRCC3P46736 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BRCC3P46736 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRCC3P46736 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms