Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXA13P31271 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms