Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms