Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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