Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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