Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT13P13646 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT13P13646 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms