Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RLBP1P12271 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms