Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTMAP06454 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTMAP06454 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTMAP06454 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTMAP06454 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTMAP06454 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTMAP06454 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTMAP06454 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTMAP06454 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTMAP06454 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTMAP06454 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTMAP06454 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTMAP06454 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTMAP06454 HAS3-202ENST00000306560 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTMAP06454 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTMAP06454 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTMAP06454 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTMAP06454 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTMAP06454 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTMAP06454 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTMAP06454 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTMAP06454 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTMAP06454 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTMAP06454 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTMAP06454 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTMAP06454 NBN-201ENST00000265433 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTMAP06454 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTMAP06454 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTMAP06454 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTMAP06454 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTMAP06454 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTMAP06454 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTMAP06454 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 OTOF-203ENST00000339598 4756 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 NBN-203ENST00000409330 4523 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 PLEKHG2-203ENST00000425673 8132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTMAP06454 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTMAP06454 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTMAP06454 USP20-202ENST00000358355 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTMAP06454 CSPG4P13-202ENST00000567704 4801 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTMAP06454 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTMAP06454 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTMAP06454 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTMAP06454 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTMAP06454 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTMAP06454 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTMAP06454 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTMAP06454 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTMAP06454 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTMAP06454 COX18-201ENST00000295890 6846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTMAP06454 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTMAP06454 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTMAP06454 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTMAP06454 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTMAP06454 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTMAP06454 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTMAP06454 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms