Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMNAP02545 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LMNAP02545 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMNAP02545 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMNAP02545 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
LMNAP02545 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMNAP02545 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMNAP02545 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMNAP02545 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMNAP02545 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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