Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP13A2-203ENST00000452699 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 RGS6-203ENST00000402788 5400 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF773-205ENST00000599847 5832 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF75D-202ENST00000370766 5592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 BCL2L13-202ENST00000337612 4905 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 ERCC5-201ENST00000355739 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 ERVK13-1-205ENST00000568395 5578 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 ATP8A1-202ENST00000381668 8270 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 PRKAB2-201ENST00000254101 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ARL2-SNX15V9GYD0 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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ARL2-SNX15V9GYD0 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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