Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP2Q9UHC6 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP2Q9UHC6 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms