Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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PPARGC1AQ9UBK2 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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PPARGC1AQ9UBK2 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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PPARGC1AQ9UBK2 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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PPARGC1AQ9UBK2 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PPARGC1AQ9UBK2 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PPARGC1AQ9UBK2 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PPARGC1AQ9UBK2 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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