Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMPRSS4Q9NRS4 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMPRSS4Q9NRS4 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMPRSS4Q9NRS4 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMPRSS4Q9NRS4 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMPRSS4Q9NRS4 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMPRSS4Q9NRS4 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMPRSS4Q9NRS4 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMPRSS4Q9NRS4 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMPRSS4Q9NRS4 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMPRSS4Q9NRS4 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMPRSS4Q9NRS4 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMPRSS4Q9NRS4 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMPRSS4Q9NRS4 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TMPRSS4Q9NRS4 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.2 ms