Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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FOXQ1Q9C009 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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FOXQ1Q9C009 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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FOXQ1Q9C009 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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FOXQ1Q9C009 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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FOXQ1Q9C009 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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FOXQ1Q9C009 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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FOXQ1Q9C009 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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FOXQ1Q9C009 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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FOXQ1Q9C009 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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FOXQ1Q9C009 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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FOXQ1Q9C009 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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