Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms