Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC12Q8WUD4 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms