Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms