Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
TRAPPC6BQ86SZ2 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TRAPPC6BQ86SZ2 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms