Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C17orf58Q2M2W7 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms