Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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