Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 MACROD2-204ENST00000407045 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AC105443.1-201ENST00000433754 712 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AP001107.9-202ENST00000531602 613 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 RN7SL202P-201ENST00000584410 262 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 LINC00449-201ENST00000366259 872 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AC078882.1-201ENST00000436132 416 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AP000959.1-201ENST00000441759 977 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AC010319.2-201ENST00000594663 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AC008555.6-201ENST00000605047 458 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 MBIP-211ENST00000621657 1809 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 AC097474.1-201ENST00000506481 1371 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 AC246787.2-202ENST00000418566 370 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 ZNF32-AS2-201ENST00000418966 905 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 AC018766.1-201ENST00000601211 484 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 RNA5SP84-201ENST00000364740 107 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 RN7SL47P-201ENST00000488710 299 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 RN7SL646P-201ENST00000492969 297 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 GACAT2-201ENST00000579368 818 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 AC015912.3-201ENST00000619432 348 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 GOLGA8G-203ENST00000525590 2009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 GOLGA8F-202ENST00000532622 2009 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GAPVD1Q14C86 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms