Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCNIQ14094 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
CCNIQ14094 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms