Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFFO1Q0D2I5 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms