Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MCCD1P59942 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MCCD1P59942 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MCCD1P59942 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCCD1P59942 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCCD1P59942 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MCCD1P59942 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCCD1P59942 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCCD1P59942 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCCD1P59942 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCCD1P59942 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCCD1P59942 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCCD1P59942 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCCD1P59942 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCCD1P59942 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MCCD1P59942 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms