Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPOP42166 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPOP42166 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPOP42166 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPOP42166 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPOP42166 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPOP42166 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPOP42166 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMPOP42166 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMPOP42166 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMPOP42166 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms