Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD1P33897 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms