Protein–RNA interactions for Protein: P30520

ADSS, Adenylosuccinate synthetase isozyme 2, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADSSP30520 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ADSSP30520 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ADSSP30520 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ADSSP30520 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ADSSP30520 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ADSSP30520 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ADSSP30520 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ADSSP30520 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ADSSP30520 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ADSSP30520 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ADSSP30520 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ADSSP30520 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ADSSP30520 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ADSSP30520 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms