Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 626.3 ms