Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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NFKB1P19838 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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NFKB1P19838 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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NFKB1P19838 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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NFKB1P19838 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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NFKB1P19838 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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NFKB1P19838 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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