Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XBP1P17861 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
XBP1P17861 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
XBP1P17861 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms