Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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CCDC88CQ9P219 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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CCDC88CQ9P219 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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CCDC88CQ9P219 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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CCDC88CQ9P219 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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CCDC88CQ9P219 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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CCDC88CQ9P219 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CCDC88CQ9P219 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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