Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms