Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCO2Q9BYV7 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms