Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACAP3Q96P50 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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