Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms