Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
APCDD1LQ8NCL9 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.5 ms